天祝藏族自治县藏医院始建于1978年，是一所集藏中西医医疗、预防、保健、科研、教学为一体的二级甲等民族医医院。为全国首批500家全面提升县级中医（民族医）医院综合服务能力第一阶段项目医院，是甘肃中医药大学藏医教学定点医院。医院藏医药浴风湿科和外治科为甘肃省重点中医药专科，内科为全省县级医疗卫生重点学科，有全国基层名中医工作室1个。

医院占地面积73.8亩，建筑面积21680平方米。核定床位320张，现有职工235名，其中：高级职称24名、中级职称43名。开设内、外、妇产、风湿病等临床医技医辅科室21个，拥有1.48T超导核磁、东芝16排螺旋CT、高压氧舱、DR、腹（宫）腔镜、奥林巴斯290胃镜、全自动生化分析仪、飞利浦A50彩超等诊疗设备。